PROPAGATION_BACTERIENNE
Description du projet :
L’objectif est de comprendre l’évolution du système immunitaire simplifié. Autrement dit comprendre l’efficacité des globules blanc sur les bactéries en fonctions de différents paramètres.
Règles de la modélisation :
Pour cette Modélisation, afin de faciliter le modèle d’étude, nous nous concentrerons simplement sur les globules blancs et la bactérie : Escherichia Coli (bactérie de référence).
Nous simulons notre modélisation dans une matrice. Les cellules de cette matrice peuvent prendre les valeurs suivantes :
- Globule Blanc (GB) => 2
- Bactérie (B) => 1
- Le vide (-) => 0
- Nutriment (N) => 3
Pour passer d’une étape à une autre on analyse le voisinage de chaque cellule de la matrice. Ce voisignage sera une “mini-matrice” de 3*3, soit les 8 nombres entourant d’une cellule. Pour l’étude de la modélisation on considère un milieu fini type boite de pétrie (ne pas prendre les voisins hors de la matrice).
Voici les différentes règles de survie des organismes (version finale 15/03) :
- Pour une cellule vide :
- Probabilité (proba_apparition_nutriments) de se transformer en un nutriment.
- Pour une bactérie :
- Si entourée d’un certain nombre de globule(s) blanc(s) (variable : nb_gb_nécessaires) : décès de la bactérie.
- Mort, si abscence d’au moins un nutriment depuis un nombre t de tours (variable : t_survie_b).
- Pour un globule blanc :
- A chaque tour, apparition (sur une case vide adjacente à une bactérie) un nombre de globule(s) blanc(s) proportionnel au nombre de bactérie (variable : gb_par_bact).
- Mort par apoptose au bout d’un nombre t de tours (variable : t_survie_gb).
- Pour un nutriment :
- Présence à proximité d’une bactérie (aucun globule blanc adjacent) : le nutriment devient une bactérie.
- Mort au bout d’un nombre t de tours (variable : t_survie_n).
Membres du groupe :
Alma Draeger. alma-draeger@live.fr
Alexandre Janin. alexandrejanin92@gmail.com
Fabien Benthami. fabien.benthami@yahoo.fr
Nadir Ait Kheddache. nadir.aitkheddache@gmail.com
Idriss Alaoui Soulimani. idrissalaouisoulimani@gmail.com
Lien du Google Docs pour les membres du groupe :
https://docs.google.com/document/d/1I5axaokHjcQKSrqvp-DZnSG8qAAc6KvY1ZnKoHlSVAg/edit?usp=sharing
Compte rendu :
Semaine 1
Semaine 2
Semaine 3
Semaine 4
Semaine 5
Semaine 6
Dernière semaine
La véritable dernière semaine